Hola.
Si quieres que no se pare en un semáforo, si tienes el Start-stop activado, pisa poco el freno y no se parará. Si quieres que se pare, solo tienes que pisar el freno con un poco más de fuerza. Así podrás hacer que se pare en el semáforo que quieras sin tener que desactivar el start-stop.
Saludos